2023
05.12.2023 — Sebastian hat für zwei Tage die Universität Münster besucht und heute einen Vortrag mit dem Titel "Modeling protein-lipid interactions: From LHCII lipid fingerprints to specific lipid binding sites" im pflanzenbiologischen Kolloquium gehalten. Vielen Dank für die Einladung und die spannenden Diskussionen!
31.10.2023 — Leider müssen wir uns heute von Marieli Goncalves Dias verabschieden. Nach einem Jahr als Gastdoktorandin in der Thallmair-Gruppe geht sie zurück an die Campinas Universität (Brasilien). Es war schön, Marieli als Teil unserer Gruppe zu haben. Wir wünschen Dir alles Gute, Marieli!
05.10.2023 — Cholesterol ist ein Kernbestandteil von Zellmembranen und daher ein wichtiges Molekül in biomolekularen Simulationen. Unser Artikel zur Entwicklung und Validierung des Cholesterol-Modells für das grobkörnige Kraftfeld Martini 3 wurde im Journal of Chemical Theory and Computation angenommen. Er trägt den Titel "Martini 3 Coarse-Grained Force Field for Cholesterol".
01.10.2023 — Wir begrüßen Saara Lautala und Thilo Duve ganz herzlich in der Thallmair-Gruppe! Saara arbeitet im Rahmen der Initiative SCALE als Postdoktorandin in Zusammenarbeit mit der Gruppe von Florian Wilfling (MPI für Biophysik) an Membrankontaktstellen. Thilo wird in seiner Masterarbeit lichtschaltbare Kinaseinhibitoren untersuchen.
15.09.2023 — Diese Woche war Sebastian auf dem Symposium Theoretische Chemie in Zürich (Schweiz). Nach vier interessanten Konferenztagen hat er heute außerdem die Gruppe von Pablo Rivera-Fuentes an der Universität Zürich besucht und einen Vortrag mit dem Titel "Protein-ligand interactions resolved by classical molecular dynamics" gehalten. Vielen Dank für die Einladung und die spannenden Diskussionen!
11.08.2023 — Wir freuen uns, dass Cristina auf dem EBSA Kongress in Stockholm (Schweden) für ihr Poster mit dem Titel "Ligand Flip-Flop on a GPCR Surface" einen Posterpreis erhalten hat! Gianmarco Lazzeri aus der Covino-Gruppe wurde ebenfalls ausgezeichnet. Herzlichen Glückwunsch, Cristina und Gianmarco!
03.08.2023 — Unsere beiden Doktorandinnen Cristina und Marieli nehmen diese Woche am EBSA Kongress in Stockholm (Schweden) teil. Beide präsentieren dort je ein Poster mit ihren Forschungsergebnissen zu G-Protein gekoppelten Rezeptoren beziehungsweise nuklearen Rezeptoren.
24.07.2023 — In Zusammenarbeit mit Wissenschaftlern von der Philipps-Universität Marburg konnten wir zeigen, dass sich das Tubby-Protein in Kontaktstellen zwischen dem endoplasmatischen Retikulum und der Plasmamembran aufhält. Dort bindet es sowohl an spezielle Lipide als auch an ein Protein, das nur in diesen Kontaktstellen auftritt. Mehr dazu können Sie in unserer Publikation mit dem Titel "Localization of the tubby domain, a PI(4,5)P2 biosensor, to E-Syt3-rich ER-PM junctions" im Journal of Cell Science nachlesen.
17.07.2023 — Auf dem CMMS-Retreat, der vom 17.-21.07.2023 am Rursee in der Eifel stattfindet, präsentiert Cristina ihre Forschungsergebnisse in einem Vortrag. Außerdem gibt Sebastian eine Einführung in grobkörnige Moleküldynamiksimulationen.
13.07.2023 — In dem FIAS-News-Beitrag "Sensor ermöglicht Analyse eines wichtigen zellulären Abfangjägers" erfahren Sie mehr über den neuartigen Glutathionsensor, den wir in Nature Chemistry veröffentlicht haben.
11.07.2023 — Heute gibt Sebastian Thallmair eine Keynote-Lecture mit dem Titel "Protein-lipid interactions resolved by coarse-grained molecular dynamics" auf der Konferenz "10th European Symposium for Plant Lipids" in Amsterdam, Niederlande. Herzlichen Dank an Teun Munnik (Universität Amsterdam), das Organisationskommittee und die Deutsche Gesellschaft für Fettwissenschaft e.V. für die Einladung auf die interessante Konferenz rund um pflanzliche Fette.
16.06.2023 — Glutathion spielt eine wichtige Rolle in Zellen: es reguliert das zelluläre Redoxpotential und ist an Signalprozessen beteiligt. Zusammen mit Wissenschaftlern an der Universität Zürich haben wir einen quantitativen Glutathionsensor entwickelt und charakterisiert, der selektiv in zellulären Substrukturen, also einzelnen Organellen eingesetzt werden kann. Unsere Ergebnisse sind jetzt in Nature Chemistry unter dem Titel "A Locally Activatable Sensor for Robust Quantification of Organellar Glutathione" erschienen.
31.05.2023 — Initiiert von Doris Hardt und Sebastian Thallmair wurde zum ersten Mal der Preis "Best FIGSS Talk" an Vortragende des FIGSS Seminars im Wintersemester 2022/2023 verliehen. Im Rahmen der Graduiertenschule FIGSS am FIAS stellen Doktorand*innen ihre Forschungsarbeiten in der zweiwöchig stattfindenden Seminarreihe vor. Seit dem Sommersemester 2022 ist Sebastian wissenschaftlicher Koordinator der Graduiertenschule FIGSS.
30.05.2023 — In internationaler Zusammenarbeit mit Forschenden aus Portugal, Frankreich, den Niederlanden, Deutschland, Kanada und den USA haben wir ein Martini 3 Model für Cholesterol entwickelt und validiert. Cholesterol ist ein Kernbestandteil von Zellmembranen und daher ein wichtiges Molekül in biomolekularen Simulationen. In unserer neuen Vorveröffentlichung können Sie mehr über das Martini 3 Model für Cholesterol erfahren.
03.05.2023 — Zusammen mit der Gruppe von Dr. Roberto Covino haben wir der Alfons und Gertrud Kassel-Stiftung, der Dr. Rolf M. Schwiete Stiftung, sowie der Johanna Quandt Stiftung, die unsere Forschungsprojekte fördern, unsere Forschungsergebnisse unter dem Titel "Biomolecular function unraveled by the computational microscope" vorgestellt. Neben Vorträgen von Cristina und Sebastian haben Marieli und Charlie ihre Ergebnisse auf Postern präsentiert. Wir möchten uns nochmal herzlich für die großzügige Förderung bedanken!
13.04.2023 — Wir freuen uns, Dr. Paulo C. T. Souza vom CNRS in Lyon (Frankreich) im ersten CMMS-Seminar des Sommersemesters 2023 zu begrüßen. In seinem Vortrag "On the road to biomolecular design with the Martini coarse-grained model" gab er einen Überblick über das Martini 3 Kraftfeld und zeigte Anwendungen im Bereich Medikamentendesign und Wirkstoffabgabe.
27.03.2023 — Wir begrüßen David Grantz und Charlie Müller ganz herzlich in der Thallmair-Gruppe! David arbeitet an seiner Doktorarbeit in der Gruppe von Ben Feringa und Wiktor Szymanski an der Universität Groningen (Niederlande) und wird in den nächsten zwei Wochen am FIAS an Docking von lichtschaltbaren Antibiotika arbeiten. Charlie studiert Biophysik an der Goethe-Universität Frankfurt. Für seine Bachelorarbeit in der Thallmair-Gruppe wird er sich mit lichtschaltbaren Lipiden beschäftigen.
13.03.2023 — In den nächsten eineinhalb Wochen wird Sebastian gemeinsam mit Dr. Roberto Covino (FIAS) und Dr. Maziar Heidari (MPI für Biophysik) die Vorlesung "Introduction to Biomolecular Simulations" an der Goethe-Universität halten.
20.02.2023 — Unsere Veröffentlichung mit dem optimierten Martini 2 Cholesterol Model ist unter dem Titel "Optimal Bond Constraint Topology for Molecular Dynamics Simulations of Cholesterol" im Journal of Chemical Theory and Computation erschienen. Außerdem beschreiben wir ein Diagnoseprogramm zur Analyse problematischer Kraftfeldbeschreibungen von Molekülen, die zu nicht-physikalischen Temperaturgradienten in Moleküldynamiksimulationen führen. Vielen Dank an Balázs Fábián und Gerhard Hummer für die gute Zusammenarbeit!
02.02.2023 — Wir haben eine interdisziplinäre Postdoc Stelle zur Untersuchung von Membrankontaktstellen mittels cryo-Elektronenmikroskopie und molekularer Modellierung zu besetzen. Die Stelle ist in Kooperation mit der Gruppe von Florian Wilfling am Max-Planck-Institut für Biophysik. Mehr Details und den Link zum Abschicken Ihrer Bewerbung finden Sie hier.
30.01.2023 — Sind Sie neugierig, wie ein Martini 3 Proteinmodel aufgesetzt wird, um Protein-Ligand-Wechselwirkungen zu untersuchen? Eine detaillierte Beschreibung finden Sie in unserem neuen Buchkapitel "Practical Introduction to Martini 3 and its Application to Protein-Ligand Binding Simulations". Glückwunsch, Cristina, und vielen Dank an alle Coautoren!
01.01.2023 — Die Thallmair-Gruppe wünscht allen ein frohes neues Jahr und freut sich auf tolle Kooperationen, spannende Forschungsergebnisse und interessante Konferenzen!
